Plongée dans les mécanismes d’organisation du génome : quand les facteurs de transcription recrutent la cohésine
Grâce à des collaborations internationales avec des équipes en Espagne et aux États-Unis, les chercheurs ont combiné des approches génomiques, structurales et de microscopie pour mieux comprendre comment les facteurs de transcription réorganisent l’architecture tridimensionnelle de la chromatine. Cette étude, menée par Grégory Fettweis et Franck Dequiedt, révèle comment ces protéines recrutent le complexe cohésine au niveau des enhancers, des régions clés qui régulent l’expression des gènes.
Le complexe cohésine joue un rôle central dans l’organisation du génome, mais les mécanismes qui dirigent sa localisation sur l’ADN restaient en grande partie inconnus. Des travaux récents, dont ceux de l’équipe, suggèrent que des interactions directes entre les facteurs de transcription et le complexe de chargement de la cohésine, formé par NIPBL et MAU2, guident cette localisation au sein des enhancers.
Les chercheurs ont identifié deux groupes de motifs d’interaction de type LxxLL dans la protéine NIPBL. Ces motifs s’avèrent essentiels pour la dynamique de NIPBL, ses partenaires d’interaction, ainsi que pour les programmes d’expression génique qu’il régule. L’un de ces clusters permet à NIPBL de s’associer à MAU2, une interaction indispensable à la formation stable du complexe NIPBL-MAU2. L’autre se lie spécifiquement aux domaines de liaison aux ligands des récepteurs stéroïdiens.
L’étude s’est notamment penchée sur le récepteur des glucocorticoïdes (GR), un régulateur majeur de nombreux processus biologiques tels que le métabolisme et l’inflammation. À l’aide d’expériences d’interactomiques et d’outils prédictifs tels qu’AlphaFold2 et des algorithmes de docking moléculaire, les chercheurs ont modélisé un complexe ternaire GR-NIPBL-MAU2 et mis en lumière son rôle dans le contrôle de l’expression génique dépendante de GR.
Enfin, au-delà de GR, l’équipe montre que de nombreux autres facteurs de transcription interagissent également avec le complexe NIPBL-MAU2 avec des surfaces d’interactions similaires ou inédites, encore à explorer.
Référence
Transcription factors form a ternary complex with NIPBL/MAU2 to localize cohesin at enhancers.
